\documentclass[12pt,a4paper,twoside,openright]{book}
%\usepackage{ucs}
%\usepackage[utf8x]{inputenc}
\usepackage[utf8]{inputenc} % Text ist UTF-8 kodiert!!!
%\usepackage{ngerman} %Deutsch neue Rechtschreibung
\usepackage{named} % \citeauthor und so Zeug
\usepackage{varioref}
\usepackage{amsmath,amssymb,amstext} % amstext um \text zu haben
\usepackage{textcomp}

\usepackage{wasysym} %Promillzeichen (\permil)
\usepackage{acronym} % Glossar

\usepackage{fancyhdr}

\usepackage{datetime} % Zeit \currenttime
%\usepackage{attachfile} % Dateien Anhängen
\usepackage{listings}
\usepackage{subfigure}
\usepackage{eso-pic} % Hintergrundgrafiken
\usepackage[pdftex]{graphicx,color} % PDF-Links
\usepackage[pdftex,
	plainpages = false, % keine ahnung was das soll
	pdfpagelabels, % seiten so nummerieren wie im dokument
	pdfstartview={Fit}, % Seite einpassen beim öffnen
%	bookmarks = true,
	bookmarksopen, % bookmarks öffnen
	bookmarksopenlevel=1, % nur eine weitere eben öffnen
%	bookmarksnumbered = true,
%	pagebackref, % aus der literatur zurück auf die seiten
%	hyperfigures,
	]{hyperref} 
%\usepackage[pdftex, plainpages=false, pdfpagelabels, pdfstartview={Fit}, bookmarksopen, bookmarksopenlevel=1]{hyperref}
\usepackage{rotating} % Tabelle drehen

\DeclareGraphicsRule{.pdftex}{pdf}{.pdftex}{#1}

\newcommand{\print}{T}
%% Für eine Print Version folgende Definition auskommentieren (F = FALSE)!
%\renewcommand{\print}{F}

\newcommand{\script}[1]{{\tt #1}}

% Kopf und Fusszeilen einstellen
% mehr dazu unter:
% http://en.wikibooks.org/wiki/LaTeX/Page_Layout

\setlength{\headheight}{15pt} % will mindestens 14.49998pt

% \setcounter{tocdepth}{2} % wie tief einbinden?

% Code for creating empty pages
% No headers on empty pages before new chapter
\makeatletter
\def\cleardoublepage{\clearpage\if@twoside \ifodd\c@page\else
    \hbox{}
    \thispagestyle{empty} %plain}
    \newpage
    \if@twocolumn\hbox{}\newpage\fi\fi\fi}
\makeatother \clearpage{\pagestyle{fancy}\cleardoublepage}

\pagestyle{fancy}{\fancyhf{}%
\fancyhead[RO]{\nouppercase{\rightmark}\hspace{2em}\thepage}%
\fancyhead[LE]{\thepage\hspace{2em}\textsc{\nouppercase{\leftmark}}}
%\fancyfoot[LE,RO]{\thepage}%
}

\fancypagestyle{normal}{\fancyhf{}%
\fancyhead[RO]{\nouppercase{\rightmark}\hspace{2em}\thepage}%
\fancyhead[LE]{\thepage\hspace{2em}\textsc{\nouppercase{\leftmark}}}
%\fancyfoot[LE,RO]{\thepage}%
}

\fancypagestyle{onlyleft}{\fancyhf{}%
\fancyhead[RO]{\thepage}%
\fancyhead[LE]{\thepage\hspace{2em}\textsc{\nouppercase{\leftmark}}}
%\fancyfoot[LE,RO]{\thepage}%
}

% plain auf empty setzen
\fancypagestyle{plain}{\fancyhf{}%
\renewcommand{\headrulewidth}{0.0pt}
%\fancyhead[LE]{\textsc{\nouppercase{\leftmark}}}
%\fancyfoot[LE,RO]{\thepage}
}

% % mal allgemein normal setzen
% \pagestyle{fancy}{\fancyhf{}%
% \fancyhead[LE]{\textsc{\nouppercase{\leftmark}}}
% \fancyfoot[LE,RO]{\thepage}}
%
% % normal setzen
% \fancypagestyle{normal}{\fancyhf{}%
% \fancyhead[LE]{\textsc{\nouppercase{\leftmark}}}
% \fancyfoot[LE,RO]{\thepage}}

% mal allgemein normal setzen
% \fancypagestyle{fancy}{\fancyhf{}%
% \fancyhead[RO]{\nouppercase{\rightmark}}%
% \fancyhead[LE]{\textsc{\nouppercase{\leftmark}}}%
% \fancyfoot[LE,RO]{\thepage}}

% \renewcommand{\headrulewidth}{0.5pt}
% \renewcommand{\footrulewidth}{0pt}

% r-lisiting einbinden mit überschrift
\newcommand{\rlisting}[2]{
\section[#2]{
\if T\print {\tt #2} \else \textattachfile{../R/#2}{\tt #2} \fi \label{chap:R:#2}
}
 \lstinputlisting{../R/#1#2}
}

% eigene Abkürzungen
\newcommand{\KW}{Kruskal-Wallis}
\newcommand{\RM}{``time series of deviation''}
\newcommand{\PM}[1]{\ac{PM$_{#1}$}}
\newcommand{\WDT}{``6-8-week-day-test''}

%\renewcommand{\th}{\textsuperscript{th}\xspace}
\newcommand{\nd}{\textsuperscript{nd}}
\newcommand{\st}{\textsuperscript{st}}
\newcommand{\kth}{\textsuperscript{th}}

\newcommand{\citet}[1]{\citeauthor{#1} (\citeyear{#1})}

\bibliographystyle{named}
%\bibliographystyle{dinat}
% abbrvdin.bst: Alphabetisch sortiertes Literaturverzeichnis mit abgekürzten Verfasservornamen und Zeitschriftentiteln. Numerische Einordnungsmarken. 
% alphadin.bst: Alphabetisch sortiertes Literaturverzeichnis mit Einordnungsmarken aus Verfasser und Erscheinungsjahrkürzeln. 
% plaindin.bst: Alphabetisch sortiertes Literaturverzeichnis mit numerischen Einordnungsmarken. 
% unsrtdin.bst: Literaturverzeichnis in Zitierfolge mit numerischen Einordnungsmarken.

\addtolength{\belowcaptionskip}{2ex}

%% HINWEIS
%%
%% labels werden wie folgt vergeben:
%% KAPITELBUCHSTABE:abb:???
%% KAPITELBUCHSTABE:tab:???
%% KAPITELBUCHSTABE:sec:???
%%
%% Also darauf achten jeweils den buchstaben des kapitels davor zu stellen, nicht dass wir noch probleme bekommen mit doppelten labels

%\attachfilesetup{icon=Paperclip, color=1 0 0, author=Peter Barmet und Thomas Kuster}

\hypersetup
{%
pdftitle = {Master Thesis},%
pdfsubject = {Weekly Periodicities in Climatology, Environmental Sciences, 9. Semester MSc Atmosphere and Climate},%
pdfauthor = {Peter Barmet, Thomas Kuster},%
pdfkeywords = {Weekly Periodicities Climatology, Master, MSc, Atmosphere and Climate, IAC},%
colorlinks = {false},% für farbe true
linkcolor = {blue}
}

\makeglossary
\makeindex

%% Titelangaben
\date{February 2008}
\author{Peter Barmet and Thomas Kuster}
\title{Weekly Periodicities in Climatology}

% Hintergrundbild bereitstellen
\makeatletter
\newcommand\BackgroundPicture{%
  \setlength{\unitlength}{1pt}%
  \put(0,\strip@pt\paperheight){%
    \parbox[t][\paperheight]{\paperwidth}{%
      \vfill %\centering
      \includegraphics[height=\paperheight,angle=0]{./images/titlepage/logo_atmosphere-rotated_1.png}
      \hfill
      \includegraphics[height=\paperheight,angle=0]{./images/titlepage/titelbild-rotated.pdf}
      \hspace{2mm}\hbox{}
      \vfill
    }
  }
} %
\makeatother

\begin{document}
\pagenumbering{roman} % cover römisch klein
\frontmatter

\lstset{% general command to set parameter(s)
language=S,
extendedchars=true,
inputencoding=latin1, % welcher Zeichensatz: TODO bewusst falsch, wäre utf8! da sonst keine einlesen möglich wenn umlaute im quellcode sind
numbers=left,
numberstyle=\small,
postbreak=\space,
breakindent=1em,
breaklines=true,
basicstyle=\ttfamily, %\small
%morekeywords={for, from, by, to, do, od, print},
keywordstyle=\color{blue},
stringstyle=\color{red},
%morecomment=[l]{\#},
commentstyle=\color[gray]{0.4}, % white comments
showstringspaces=false % no special string spaces
}

% make the title
%\addtolength{\hoffset}{0.5cm}
\begin{titlepage}
\hspace{1.2cm} %1.5
\begin{minipage}[t]{0.8\linewidth}
\vspace{-4cm}
\hspace{0.15cm}\includegraphics[width=0.5\linewidth]{./images/titlepage/logo.pdf} %-0.2

\centering
\vspace{0.2\textheight}
{\Huge Weekly Periodicities\\\vspace{1ex} in Climatology}

\vspace{0.35\textheight}
{\Large Master Thesis\\\vspace{1ex}}
February 2008

\vspace{0.1\textheight}
{\Large Authors\\\vspace{1ex}}

\begin{minipage}[t]{0.4\linewidth}
\flushleft
Peter Barmet %\\
%Berta-Reginastrasse 7a\\
%6020 Emmenbrücke
\end{minipage}
%\hspace{\fill}
\begin{minipage}[t]{0.4\linewidth}
\flushright
Thomas Kuster %\\
%Feldhofstrasse 20\\
%8610 Uster\\\vspace{2ex}
\end{minipage}

\vspace{0.1\textheight}
\begin{minipage}[t]{0.4\linewidth}
\flushleft
{\Large Supervisor\\\vspace{1ex}}
Ulrike Lohmann
\end{minipage}
%\hspace{\fill}
\begin{minipage}[t]{0.4\linewidth}
\flushright
{\Large Advisor\\\vspace{1ex}}
Andreas Mühlbauer
\end{minipage}
\end{minipage}
\AddToShipoutPicture*{\BackgroundPicture{}}
\end{titlepage}
%\addtolength{\hoffset}{-0.5cm}

%\maketitle

% notwendig?
\newpage 
\thispagestyle{empty}
\quad
\newpage

\setcounter{page}{1}
\pagenumbering{Roman} % grosse römische Seitenzahlen für den ``Vorspann''

%% TODO
\section*{Weekly periodicities in climatology}

Master Thesis at the \ac{IACETH}. This institute is part of the Department of Environmental Sciences (D-UWIS).
\vspace{1ex}\\
\noindent Authors: Peter Barmet and Thomas Kuster
\vspace{1ex}\\
\noindent Semester: Autumn 2007
\vspace{1ex}\\
\noindent Supervised by IAC Professor Ulrike Lohmann and PhD student Andreas Mühlbauer

\section*{Thanks}
% TODO noch ein sätzchen? à la wir bedanken uns bei den folgenden person herzlich für ihre unterstützung.
We cordially thank the follwing persons:
\vspace{1ex}\\
\noindent Dominik Auf der Maur (proofreading), Caroline Baumgartner (proofreading), Tracy Ewen (proofreading), Reto Knutti (hints for the autocorrelation in simulations), Bettina Kuster (mental succour), Ulrike Lohmann, Massimo Merlini (statistical hints), David Masson (proofreading), Andreas Mühlbauer, Hans Richner \cite{richner2007}, %(English Geographical Terminology, \citeyear{richner2007}),
Ariane Ritz (mental succour), Stefan Ritz (proofreading), Claudia Ryser (proofreading), Christoph Schär (6 and 8-day-week), Marc Wüest (handyman) % TODO alle? was schreiben wir bei ulrike und andreas?

\vspace{\fill}
\noindent Date and time of the \LaTeX{}-run: \today{} at \currenttime

\pagestyle{onlyleft}
\tableofcontents

%%
%\addcontentsline{toc}{chapter}{List of Figures}
\listoffigures

%%
%\addcontentsline{toc}{chapter}{List of Tables}
\listoftables

\cleardoublepage

\mainmatter
\pagestyle{normal}
%\chapter*{Abstract}
\pagenumbering{arabic}%--- Ab hier: Gewöhnliche Seitennummerierung
%\input ./chapters/abstract.tex

\chapter{Introduction}\label{chap:Introduction}
\input ./chapters/introduction.tex

% In a paper from \citeauthor{baeumer2007feb}
% U can c \dots \cite{baeumer2007feb}.
% \citeauthor{baeumer2007feb} introduced the bootstrap \shortcite{baeumer2007feb}.

\chapter{Theory}\label{chap:theory}
\input ./chapters/theory.tex
%Like we have seen in \vref{chap:Introduction}.

\chapter{Methods}\label{chap:methods}
\input ./chapters/methods.tex

\chapter{Results}\label{chap:results}
\input ./chapters/results.tex

\chapter{Discussion}\label{chap:discussion}
\input ./chapters/discussion.tex

\chapter{Conclusion and Outlook}\label{chap:conclusion_outlook}
\input ./chapters/conclusion_outlook.tex

% \chapter{Test Bilder}
% \input ./chapters/abbildungen.tex

\cleardoublepage
\addcontentsline{toc}{chapter}{Bibliography}
\pagestyle{onlyleft}
\bibliography{./literatur/literatur}

\appendix
\chapter{Database}\label{chap:database}
\pagestyle{normal}
\input ./chapters/database.tex

\chapter{GNU R Programmes}\label{chap:R}
\input ./chapters/R.tex

\chapter{End of the Gedanken Experiment}\label{appendix:gedanken_experiment}
\input ./chapters/gedanken_experiment.tex

\chapter{Glossar}\label{chap:glossar}
\input ./chapters/abbreviation.tex

\end{document}